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16小時(shí)就揭開(kāi)病毒“真面目”,深圳疾控新冠溯源團(tuán)隊(duì)做了什么?
2022-01-12 21:53
來(lái)源: 深圳商報(bào)

16小時(shí)就揭開(kāi)病毒“真面目”,深圳疾控新冠溯源團(tuán)隊(duì)做了什么?

人工智能朗讀:

讀特客戶端·深圳新聞網(wǎng)2022年1月12日訊深圳商報(bào)記者 袁靜嫻)近幾日,深圳市疾控中心的應(yīng)急實(shí)驗(yàn)樓徹夜燈火通明。這里是深圳市疾控中心新冠溯源團(tuán)隊(duì)的實(shí)驗(yàn)場(chǎng)所。從1月6日晚上,拿到此次“0107”疫情的第一個(gè)新冠病毒核酸檢測(cè)陽(yáng)性樣本開(kāi)始,這支團(tuán)隊(duì)已經(jīng)連軸轉(zhuǎn)了4天5夜。

1月10日,深圳通報(bào),“0107”疫情前4個(gè)病例感染的毒株均為德?tīng)査儺愔辏ˋY.103進(jìn)化分支),且100%同源。綜合分析,本起疫情源頭為境外輸入引起的本土疫情,暴露于境外新冠病毒污染物品引起感染的可能性大。為查清疫情源頭做出重大貢獻(xiàn)的,正是深圳市疾控中心新冠溯源團(tuán)隊(duì)。

“早一分鐘確定傳染源,就為跑贏新冠病毒增加多一分勝算?!?0日,深圳市疾病預(yù)防控制中心病原生物研究所副所長(zhǎng)、深圳疾控新冠溯源團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人何雅青接受讀創(chuàng)/深圳商報(bào)記者專訪時(shí)如此表示。此次,何雅青帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)僅用16小時(shí),就查清了本起疫情病例1、2感染的新冠病毒型別,較之前足足提前了8小時(shí)。

爭(zhēng)分奪秒,凌晨5點(diǎn)狂奔回所

時(shí)間回到1月6日。

當(dāng)天晚上10點(diǎn)半左右,何雅青接到深圳本地的“10混1”核酸檢測(cè)樣本里有一個(gè)呈可疑陽(yáng)性,拿到核酸初篩的熒光PCR結(jié)果圖,看了幾眼,憑著豐富的經(jīng)驗(yàn),她已基本確定深圳可能出現(xiàn)新冠病毒感染病例。

“本土出現(xiàn)新冠病毒感染病例,這是大事,必須馬上進(jìn)行病毒基因溯源?!焙窝徘嗄X中的警鈴立馬拉響,她第一時(shí)間打電話給團(tuán)隊(duì)相關(guān)成員,做好要回單位做新冠病毒全基因組序列測(cè)定的準(zhǔn)備。何雅青立即給中心領(lǐng)導(dǎo)發(fā)了信息——“已安排:如出現(xiàn)陽(yáng)性病例,第一時(shí)間測(cè)序”。

晚上11點(diǎn)半,經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)確認(rèn),證實(shí)是新冠病毒核酸陽(yáng)性。之后,第二個(gè)核酸檢測(cè)可疑陽(yáng)性的樣本也送到市疾控中心,經(jīng)實(shí)驗(yàn)室確認(rèn),證實(shí)出現(xiàn)第二例新冠病毒感染者。

基因測(cè)序需要經(jīng)過(guò)樣本前處理、文庫(kù)構(gòu)建、測(cè)序反應(yīng)、生物信息學(xué)分析等步驟,其中,文庫(kù)構(gòu)建包括RNA反轉(zhuǎn)錄、擴(kuò)增等。團(tuán)隊(duì)里的朱燦身兼核酸檢測(cè)和病毒溯源組的工作,7號(hào)凌晨4點(diǎn),核酸檢測(cè)工作結(jié)束后,朱燦又連忙開(kāi)始了做基因測(cè)序的文庫(kù)構(gòu)建的第一步,進(jìn)行RNA反轉(zhuǎn)錄?!盎驕y(cè)序流程一環(huán)扣一環(huán),特別是出現(xiàn)了本土病例,每個(gè)人都打起了100分精神,不敢絲毫松懈?!焙窝徘嗾f(shuō),在這緊張忙碌的過(guò)程中,發(fā)生了很多讓她感動(dòng)的事。

為了盡快出結(jié)果,按何雅青幾小時(shí)前的安排,1月7號(hào)凌晨5點(diǎn),天還沒(méi)亮,測(cè)序組的魏欣儀就已經(jīng)急忙從家里趕回單位,著手測(cè)序工作。組里另一成員陳龍?jiān)?號(hào)白天出發(fā)去甘肅提親,得知出現(xiàn)本土病例需要病毒溯源后,考慮到疫情影響怕不能及時(shí)返深,7號(hào)早上五六點(diǎn)便打電話給何雅青,表示推遲提親,先回所里開(kāi)展工作。

基因溯源,讓病毒來(lái)源“一錘定音”

7號(hào)早上八點(diǎn)多,官方公布深圳報(bào)告2例新冠確診病例的消息后,坊間開(kāi)始有謠言出現(xiàn),有人說(shuō)是奧密克戎,有人說(shuō)是德?tīng)査榱吮M快出結(jié)果,堵住謠言,團(tuán)隊(duì)更是不敢松懈?!皽y(cè)序反應(yīng)步驟結(jié)束下機(jī)時(shí),拿著原始數(shù)據(jù),組員李詩(shī)敏和盧清菊從二樓跑到四樓,第一時(shí)間把U盤插到服務(wù)器上,迅速開(kāi)始拼接病毒基因序列,一秒鐘都不敢耽誤?!焙窝徘嗾f(shuō),“還有,學(xué)生屈雅麗在本次溯源中,也十分投入,成長(zhǎng)很快?!?/p>

1月7日晚上8時(shí),基因測(cè)序結(jié)果出爐,顯示此次病例1和病例2感染的新冠病毒為德?tīng)査儺愔辏ˋY.103進(jìn)化分支),兩者的同源性為100%。“是德?tīng)査儺愔?,不是奧密克戎!”報(bào)告的出爐為病毒型別“一錘定音”,何雅青也大松一口氣,立馬把這消息向上級(jí)領(lǐng)導(dǎo)報(bào)告。

晚上11點(diǎn)12分,深圳衛(wèi)健委微信公眾號(hào)發(fā)文“深圳2例確診病例基因測(cè)序結(jié)果:為德?tīng)査儺愔辍?。推文一出,大家紛紛轉(zhuǎn)發(fā)。對(duì)所有人來(lái)說(shuō),這都是一個(gè)好消息。

何雅青告訴記者,奧密克戎相對(duì)德?tīng)査瑐鞑バ愿鼜?qiáng),如果是奧密克戎,深圳恐怕會(huì)面臨更大的挑戰(zhàn),相關(guān)工作人員的排查工作也會(huì)更艱巨。“更重要的是,我們此前還沒(méi)有處理奧密克戎的經(jīng)驗(yàn),這意味著風(fēng)險(xiǎn)性也更大?!?/p>

技術(shù)護(hù)航,科學(xué)研判疫情

何雅青介紹,此次新冠病毒全基因組序列測(cè)定使用的是高通量測(cè)序技術(shù),也稱二代測(cè)序技術(shù)?!?021年5月11日國(guó)家發(fā)布的第八版新冠肺炎防控方案中有明確指出新冠病毒溯源要使用二代測(cè)序技術(shù),我們單位一直采用這個(gè)技術(shù)進(jìn)行新冠病毒的溯源實(shí)驗(yàn),包括去年的‘5.21’和‘6.14’疫情。”

在何雅青看來(lái),出現(xiàn)新冠病毒本土病例后,第一時(shí)間進(jìn)行病毒溯源十分重要?!拔覀兪紫纫_定病毒的型別,然后要確定病毒的來(lái)源。對(duì)不同型別的新冠病毒,我們劃定的重點(diǎn)人群和重點(diǎn)區(qū)域,以及所采取的防控措施是有所不同的。其次,通過(guò)與深圳、廣東省、全國(guó)輸入病例以及國(guó)外的新冠病毒序列的比較,可以確定病毒的源頭”,何雅青表示,通過(guò)病毒基因序列的比對(duì),可以推斷疫情的傳播的源頭是否是同一來(lái)源——如果病例的新冠病毒全基因序列高度同源,可以推斷是同一感染來(lái)源或同一傳播鏈。如果新冠病毒全基因序列不是同一個(gè)型別,或者同源性不高,就可以推斷是不同來(lái)源的新冠病毒,這對(duì)疫情的研判起到至關(guān)重要的作用。

年輕“勁”足,與病毒源頭抗戰(zhàn)到底

高效溯源工作背后,是一支年輕的團(tuán)隊(duì)。

第一個(gè)“年輕”是成立時(shí)間短。2020年1月,何雅青工傷初愈回到所里上班后,第一件事就是組建新冠溯源平臺(tái)?!白鳛橐粋€(gè)病毒分子流行病學(xué)的研究學(xué)者,我始終覺(jué)得我們?cè)撚凶约旱牟《净蛩菰磮F(tuán)隊(duì)?!焙窝徘嗾f(shuō)干就干,擬項(xiàng)目、組團(tuán)隊(duì)、買設(shè)備,深圳市疾控中心新冠溯源團(tuán)隊(duì)不到一個(gè)月就已成形。

第二個(gè)“年輕”是平均年齡小。何雅青組建的這支團(tuán)隊(duì),平均年齡也很年輕,大部分為90后,甚至還有00后?!安《舅菰床⒉皇且粋€(gè)輕松的工作,我們常常要跟病毒賽跑。”在何雅青看來(lái),年輕人有活力,有干勁,學(xué)習(xí)快,肯吃苦,正好與基因溯源工作相契合。

自組建以來(lái),不分白日晝夜,不分節(jié)假日,熬夜加班成了這支團(tuán)隊(duì)的家常便飯。平時(shí),他們需要承擔(dān)新冠病毒日常檢測(cè)和確認(rèn)、信息報(bào)送工作,遇到新冠病毒陽(yáng)性樣本報(bào)告時(shí),便要爭(zhēng)分奪秒地開(kāi)始新冠病毒溯源工作。“每完成一次溯源工作,判斷出病毒的源頭,我們都會(huì)深感自豪?!焙窝徘嗾f(shuō)。

從“5.21”到“6.14”,再到此次的“0107”疫情,這已經(jīng)是團(tuán)隊(duì)第三次遇到突發(fā)新冠病毒本土病例的“考試”。每一次,何雅青的團(tuán)隊(duì)交出的“考卷”分?jǐn)?shù)都刷新高,基因測(cè)序時(shí)長(zhǎng)從一開(kāi)始的27小時(shí)到24小時(shí),再到這次的16小時(shí),為政府決策以及流調(diào)人員排查潛在感染者(密切接觸者)多爭(zhēng)取了寶貴的8小時(shí),保護(hù)了更多人的生命健康。

[編輯:黃春才]